Prueba: archivo compartido

https://dl.dropbox.com/u/96577330/SWM%20situation%20in%20Pakistan.pdf

Lodos aceitosos

Para aquellos que preguntaron acerca de los lodos aceitosos, pueden leer los dos primeros párrafos de la Introducción de este artículo:

http://redalyc.uaemex.mx/src/inicio/ArtPdfRed.jsp?iCve=37017102

Reactores de suelos activados:
http://sena.academia.edu/ANDERSSONREYESPOSADA/Papers/1490310/Procesos_de_biorremediacion_de_suelo_y_agua_contaminados_por_hidrocarburos_del_petroleo_y_otros_compuestos_organicos

Lodos activados:
http://www.gunt.de/download/CE705_flyer_spanish.pdf

Clase del viernes 18 de mayo

Se les comunica que el día viernes 18 de mayo estaremos atendiendo el cierre del "Diplomado en Competencias Profesionales" por lo que se suspende la clase. Nos vemos el día lunes 21 de mayo a las 12 horas. No falten pues estamos ya (un poco) desfasados respecto del programa.

IQ4701

Revisión de mapas conceptuales y Cuestionario

Ya revisé ambos. En general están bien. Solo dos observaciones. Una, las respuestas a los cuestionarios parecería que solo las hubiera hecho una sola persona, pues son iguales. Está bien que la traducción la hayan hecho juntos, pero en algunas respuestas es inverosímil que todos respondan de la misma manera.

Dos, los mapas conceptuales casi no se alcanzan a leer. Me pregunto si los hicieron con Cmap Tool y si exportaron el archivo como imagen jpeg para luego insertarla en sus blogs.

Como quiera las tareas fueron pensadas para que se familiarizaran con los blogs y los mapas conceptuales elaborados en computadora. Creo que dificultades más o dificultades menos, todos lo hicieron.

Tareas

De acuerdo al artículo: Role of Microbial Enzymes in the Bioremediation of Pollutants: A Review, conteste:

1.- Enumere algunas de las tecnologías mencionadas para la disposición de desechos, sus ventajas y desventajas.

2.- ¿En qué lugares o sitios se aplica la fitorremediación?

3.- ¿De qué o de quién depende principalmente el proceso de biorremediación?

4.- ¿Cuáles factores o parámetros limitan el crecimiento microbiano?

5.- ¿Qué son las enzimas? ¿las apoenzimas? ¿los grupos prostéticos?

6.- Enumere las seis clases o familias de enzimas. ¿Que tipo de reacción cataliza cada una de ellas?

7.- ¿De dónde extraen la energía los microbios?

8.- ¿Como actúan las oxigenasas y cuántas categorías hay de las mismas?

9.- ¿Que tipo de enzimas tienen un uso potencial diverso en las industrias alimenticia, de aditivos, ciencias biomédicas y química?

10.- ¿Cuál es la importancia de las enzimas microbianas?

Elabore un mapa conceptual del artículo: La biodegradación de hidrocarburos y su aplicación en la biorremediación de suelos, páginas 1, 2 y 3.

Pueden hacerlo a más tardar antes del día lunes 26.

Programa para crear mapas conceptuales

http://cmap.ihmc.us/download/dlp_CmapTools.php?myPlat=Win

Para Windows hay una versión ligera: CmapLite. Todas son gratuitas y el sitio es seguro.

Este otro sitio tiene un tutorial para la descarga e instalación del programa:

http://www.eduteka.org/Cmap1.php

Textura del suelo

Mi lista de blogs 2012-1

Ya han sido enlazados los blogs de 5 de ustedes, aunque en sentido estricto sólo Kary y Guillermo tienen por lo menos una entrada publicada . Los demás o tienen mal la dirección o no han proporcionado todavía alguna. Los blogs son para publicar entradas, por lo que sugiero elaboren una y la publiquen. No tiene que ser muy larga, puede ser de uno o dos párrafos. Por ejemplo ¿que entiendo por Biorremediación o por qué me interesa esta asignatura?

Karina: Necesitas eliminar las entradas anteriores de tu blog o en su defecto crear uno nuevo. Por favor haz esto a la brevedad.

Guía de Examen Global

1.- Defina Biorremediación. ¿A qué nos referimos con Biodegradabilidad y Biodisponibilidad de un contaminante? ¿Qué se conoce como Bioestimulación y como Bioaumentación? 

2.- Describa la composición y propiedades de los suelos en general.

3.- Mencione algunas de las fuentes u orígenes de la contaminación en suelos y aguas subterráneas. Indique algunos de los efectos de la contaminación sobre los recursos naturales.

4.- Describa de manera general el proceso de degradación de contaminantes orgánicos en suelos.

5.- Describa detalladamente las vías de degradación de los alcanos. ¿Cómo se denominan las enzimas que actúan en la primera etapa de la reacción? ¿Qué tipo de productos son los intermediarios de la reacción? ¿Qué sucede durante la Beta-oxidación? 

6.- Describa con detalle las vías de degradación aerobia de compuestos aromáticos. ¿Cómo se llaman las primeras enzimas que intervienen en la reacción? ¿Cuáles son los principales intermediarios de la reacción? ¿Cómo se llaman las dos rutas principales de la degradación? A grandes rasgos ¿qué tipo de reacciones se llevan a cabo en todo el proceso? 

7.- Defina Deshalogenación o Descloración Reductiva. ¿Qué sucede en este tipo de reacciones?

8.- Defina y explique el Cometabolismo.

9.-  Mencione las ventajas y desventajas de las tecnologías de remediación in situ y ex situ.

10.- Describa alguna de las siguientes tecnologías de biorremediación: Fitorremediación, Composteo, Biolabranza, Bioventeo, Biorreactores. Descripción y características del proceso. Limitaciones. Aplicaciones. Duración y costo comparativo del tratamiento respecto de otras tecnologías

Primer parcial-Recuperación

Entregar el jueves (de preferencia) o viernes a más tardar, diez artículos de revisión (cuatro de ellos impresos) relacionados a cualquiera de los temas del programa de estudios de Biorremediación.

Nota importante: Los diez artículos deben poderse descargar de internet en formato *pdf (adobe acrobat). No se admiten páginas web (html) o referencias que no puedan ser obtenidas directamente de internet (es decir, tal vez la revista se encuentra disponible en la UNAM o en la UAM, pero el artículo no se puede descargar en forma directa de la red). En este último caso, la solución sería que trajeran los artículos en impreso.

Avisar en este blog, en la última entrada publicada y como comentario, según vayan encontrando los artículos para que no se repitan los mismos entre ustedes.

Sugerencia de fuentes de información:

Redalyc
Dialnet
Scielo
www.ndltd.org

Lecturas

Degradación del suelo. 5. Importancia de la degradación del suelo y estado actual.

http://edafologia.ugr.es/conta/tema10/import.htm

Contaminación del suelo e impacto ambiental. 1 Concepto de contaminación del suelo.

http://edafologia.ugr.es/conta/tema11/concep.htm

2 Desarrollo histórico

http://edafologia.ugr.es/conta/tema11/historia.htm

3.Agentes contaminantes y su procedencia

http://edafologia.ugr.es/conta/tema11/agentes.htm

4 Procesos responsables de la redistribución y acumulación

http://edafologia.ugr.es/conta/tema11/proces.htm

Los incendios en zonas de tundra ....

http://noticiasdelaciencia.com/not/2101/los_incendios_en_zonas_de_tundra_podrian_acelerar_el_calentamiento_global/

Biorremediación Semestre 2011-2

En la parte superior derecha se encuentra la Bibliografía Básica. El primer artículo se intitula "Fundamentos de Biorremediación", tienen que leerlo y elaborar un mapa conceptual del mismo.

En este enlace:
http://cmap.ihmc.us/download/dlp_CmapTools.php?myPlat=Win

pueden descargar un programa para elaborar mapas conceptuales. Les recomiendo la versión Lite (ligera).

Guía de Estudio para el Examen Global

1.- Defina Biorremediación. 

2.- ¿A qué nos referimos con Biodegradabilidad y Biodisponibilidad de un contaminante? 

3.- ¿Qué se conoce como Bioestimulación y como Bioaumentación? 

4.- Describa la composición y propiedades de los suelos en general.

5.- Mencione algunas de las fuentes u orígenes de la contaminación en suelos y aguas subterráneas. Indique algunos de los efectos de la contaminación sobre los recursos naturales.

6.- Describa de manera general el proceso de degradación de contaminantes orgánicos en suelos.

7.- Mencione diferentes tipos o familias de contaminantes que son tratados mediante la Biorremediación en suelos y aguas superficiales y subterráneas.

8.-  Describa y explique un tipo de interacción contaminante-suelo, de entre los siguientes: Absorción, Adsorción, Disolución, Descomposición Química.

 

9.- ¿A qué se refieren las siglas en inglés LNAPL y DNAPL, y en qué tipo de situaciones se presentan?   

10.- ¿En qué tipo de procesos o interacciones con el suelo la masa del contaminante se mantiene y en cuáles disminuye?  

11.- Describa detalladamente las vías de degradación de los alcanos (Reineke, página 88). ¿Cómo se denominan las enzimas que actúan en la primera etapa de la reacción? ¿Qué tipo de productos son los intermediarios de la reacción? ¿Qué sucede durante la Beta-oxidación? 

12.- Describa con detalle las vías de degradación aerobia de compuestos aromáticos (Fritsche & Hofrichter, página 154). ¿Cómo se llaman las primeras enzimas que intervienen en la reacción? ¿Cuáles son los principales intermediarios de la reacción? ¿Cómo se llaman las dos rutas principales de la degradación? A grandes rasgos ¿qué tipo de reacciones se llevan a cabo en todo el proceso? 

13.- Defina Deshalogenación o Descloración Reductiva.

14.- ¿Como se llaman los dos principales intermediarios de las rutas de degradación de los compuestos aromáticos?

15.- Describa la ruta metabólica para la degradación del naftaleno (diagrama de Grbic-Galic, 1988). ¿Que se representa en el mismo? ¿Qué tipo de microorganismos intervienen?

16.- Describa el diagrama de la degradación aerobia de hidrocarburos (Fritsche & Hofrichter, página 146). ¿Cuál es el sustrato primario y cuál el secundario? ¿Qué tipo de reacciones se llevan a cabo? ¿Qué enzimas intervienen en las reacciones? ¿Ambos sustratos sirven como fuente de carbono y de energía o que tipo de metabolismo se lleva a cabo? 

17.- Defina Cometabolismo.

18.- En términos de la energía libre de Gibbs: ¿cuándo las reacciones químicas se consideran endergónicas y cuándo exergónicas? ¿cuándo son favorables o desfavorables para la actividad metabólica de una célula? 

19.-  Mencione las ventajas y desventajas de las tecnologías de remediación in situ y ex situ.

20.- Mencione las tecnologías de Biorremediación de tipo aerobio, anaerobio y mixtas. ¿Cuáles son los aceptores de electrones para cada una de ellas? 

21.- Describa la tecnología de Fitorremediación. Descripción y características del proceso. Limitaciones. Aplicaciones. Duración y costo comparativo del tratamiento respecto de otras tecnologías

22.- Describa la tecnología de Composteo. Descripción y características del proceso. Limitaciones. Aplicaciones. Duración y costo comparativo del tratamiento respecto de otras tecnologías.

23.- Describa la tecnología de Biolabranza. Descripción y características del proceso. Limitaciones. Aplicaciones. Duración y costo comparativo del tratamiento respecto de otras tecnologías.

24.- Describa la tecnología de Bioventeo. Descripción y características del proceso. Limitaciones. Aplicaciones. Duración y costo comparativo del tratamiento respecto de otras tecnologías.

25.- Describa la tecnología de Biorreactores de Suelos Activados. Descripción y características del proceso. Limitaciones. Aplicaciones. Duración y costo comparativo del tratamiento respecto de otras tecnologías.

De esta guía se seleccionarán cinco o diez preguntas para el examen global. 


En la parte superior derecha he puesto enlaces de consulta de bibliografía.

Programación Presentación Estudios de Caso-Última Actualización

1.- Guadalupe

5	Biocell Technology, Ex Situ Bioremediation of Petroleum-Contaminated Soils, Port Hueneme, CA (1998)

2.- Brenda

1	Phytoremediation at Palmerton Zinc Pile Superfund Site, Palmerton, Pennsylvania(2007)

3.- Sara

1	Phytoremediation at Twin Cities Army Ammunition Plant, Minneapolis-St. Paul, Minnesota (2000)

4.- Marisela

1	Ex Situ Bioremediation of Soil at Two Drycleaner Sites, Various Locations (2001)

5.- Ana Laura

17	Windrow Composting of Explosives Contaminated Soil at Umatilla Army Depot Activity Hermiston, Oregon (1995)

6.- María Teresa

1	In Situ Bioremediation at Vandenberg Air Force Base, Lompoc, California (2001)

7.- Paola

9	Phytoremediation at Aberdeen Proving Grounds, Edgewood Area J-Field Site, Edgewood, MD (2002)

8.- Ana Karen

4	Composting at the Dubose Oil Products Co. Superfund Site, Cantonment, Florida(1997)

9.- Hugo Iván

1	In Situ Bioremediation and Soil Vapor Extraction at the Former Beaches Laundry & Cleaners (2010)

10.- Aurelio

11	In Situ Bioremediation at Brownfield Site, Chattanooga, Tennessee (2001)

11.- Jonathan Diego

7	Compost-free Bioreactor at Leviathan Mine Superfund Site, Markleeville, California(2007)

12.- Diego

110	DNAPL Bioremediation-RTDF at Dover AFB, Area 6, Dover, Delaware (2002)

13.- Karina

6	Pump and Treat and In Situ Bioremediation of Contaminated Groundwater at the Libby Groundwater Superfund Site, Libby, Montana (1998)

14.- Angélica

1	Enhanced In-Situ Anaerobic Bioremediation of Chlorinated Solvents at LF-08, Whiteman Air Force Base, Missouri (2007)

15.- Irais

6	In Situ Bioremediation of Perchlorate in Groundwater at the Aeroject Facility, Sacramento, California (2009)

16.- Elena

15	In Situ Bioremediation Using HRC® at a Former Industrial Property, San Jose, CA(2004)

17.- Karina Isabel

2	Remediation of DNAPL through Sequential In Situ Chemical Oxidation and Bioaugmentation (2010)

18.- Claudia

10	In Situ Bioremediation at the Cleaners #1 Site, Kent, Washington (2006)

19.- Israel

27	Bioremediation at the Stauffer Management Company Superfund Site, Tampa, Florida (2001)

20.- Lucio

1	Soil Vapor Extraction and Bioventing for Remediation of a JP-4 Fuel Spill at Site 914, Hill Air Force Base, Ogden, Utah (1995)

21.- Mariana

282	Ex Situ Bioremediation at Novartis Site, Cambridge, Ontario (1998)

Aquellas personas que no expusieron su tema, lo harán el viernes 8 de julio de 10 a 11 horas en el salón C-201. Posteriormente se les aplicará el Tercer examen parcial con los temas de Tecnologías de Tratamiento: Arado de suelo, Bioventeo, Fitorremediación, Composteo, Reactores de suelos activados.

Instrucciones Detalladas para el Estudio de Caso

Considerando que las instrucciones se les dieron por vez primera el lunes 13 de junio, y a la fecha hay personas que aún no eligen el tema a presentar, vamos a modificar la presentación. Solo habrá una Etapa I con presentación individual oral e impresa. Esta será el lunes 27 de junio para las 10 primeras personas de la lista, y el viernes 1 de julio para las restantes 11. El viernes 24 de junio habrá clase y será para resolver dudas, por lo cual deberán llevar el resumen y el reporte de su caso elegido. Individualmente presentarán su Estudio de Caso y sus compañeros deberán preguntarles (con base en los conocimientos adquiridos durante el curso) si pudiera haber tratamientos alternativos o por qué no es posible utilizar otro tipo de tecnología.


Estudios de Caso


Etapa I: 

Este trabajo lo deberán presentar de manera individual, mediante Exposición en clase, 20 minutos máximo, junto con entrega de material impreso. Deberán notificarme con antelación el caso a tratar, para evitar repeticiones.

Para elegir el Estudio de Caso, entran a la siguiente página:

http://www.frtr.gov/

Dan click en: "Cost & Performance Case Studies"

Enseguida dan click en: "FRTR Remediation Case Study Searchable Database"

Ya ahí,  van a la casilla de "Primary Technology" y marcan la casilla de Biorremediación -Bioremediation (ex situ) All o Bioremediation (in situ) All-. Hasta abajo dan click en Search Case Studies.

En Bioremediation (ex situ) All hay 17 entradas o casos disponibles. En el caso de Bioremediation (in situ) All hay 64 entradas o casos disponibles. Adicionalmente en Fitorremediación hay 15 casos disponibles.


Si quieren delimitar la búsqueda, en los tratamientos ex situ están: composteo, biolabranza y suelos activados. En el caso de tratamientos in situ están: bioventeo y bioremediación aumentada.


En total de Biorremediación hay 96 casos, y ustedes son 21. Creo hay de donde elegir sin repetir los temas.


Por ejemplo si alguno eligiera el caso número 45 de la Biorremediación in situ: Biorremediación in situ en la costa del Golfo de Tejas, Houston, Texas, primero se muestra un resumen del caso describiendo: nombre del sitio, localización, periodo de operación, tipo de limpieza, agencia contratada, tecnología, contaminantes, fuente de origen, tipo y cantidad de medio tratado, propósito de la aplicación, objetivos de limpieza, resultados, costos, descripción.


En la parte superior derecha, dan click en Download Report y obtienen el reporte in extenso.


Necesito que me hagan saber el caso elegido dando el tipo de tratamiento: por ejemplo, Biorremediación ex situ, número 1 a 17; Biorremediación in situ, número 1 a 64; Fitorremediación, número 1 a 15. 


Cualquier duda a través del blog, o en el edificio J o el viernes 24. 

Estudios de Caso

Etapa I: 

Este trabajo lo deberán presentar de manera individual, mediante una Exposición en clase, 15-20 minutos máximo, junto con entrega de material impreso. Deberán notificarme con antelación el caso a tratar, para evitar repeticiones.

Para elegir el Estudio de Caso, entrar a la siguiente página:

http://www.frtr.gov/

Dar click en: "Cost & Performance Case Studies"

Enseguida dar click en: "FRTR Remediation Case Study Searchable Database"

Ya ahí,  hay 423 reportes disponibles.Pueden desplegar todos los estudios disponibles (Display All Case Studies) o bien ir a la casilla de "Primary Technology" y elegir algún caso de Biorremediación (Bioremediation).

Por ejemplo, si se eligiera "Bioremediation (In situ) All", hay que dar click hasta abajo de la página en "Search Case Studies". A continuación se muestra el título de 64 casos. Dar Click en el caso elegido.

Por ejemplo: "Enhanced In-Situ Anaerobic Bioremediation of Chlorinated Solvents at FF-87, Former Newark Air Force Base, Ohio".

En esa página aparece un Resumen del caso. Para ver el estudio en detalle, dar click en "Download Report". En algunos casos, la información tarda en desplegarse.

Deberán trabajar tanto con el Resumen como con el Reporte In Extenso.

Etapa II:

En una segunda etapa, deberán formar equipos de tres personas, elegir uno de los tres casos tratados y:

a) ya sea proponer una alternativa de tratamiento (en base a los conocimientos adquiridos durante el curso), o bien,

b) discutir por qué no es posible llevar a cabo otros tratamientos de Remediación.

Entregar trabajo impreso igualmente.

Resumiendo:


Es una presentación individual y otra de trabajo en equipo; junto con entrega de dos impresos, uno individual y otro conjunto.

Recuperación Segundo Parcial

Para los que van a presentar Examen de Recuperación el próximo viernes 3 de junio, después de clase, el temario es básicamente el mismo.

Aquellas personas que no entregaron Trabajo de Investigación, deberán entregar uno a más tardar el lunes 6 de junio en clase, sobre Grupos de Investigación en México que trabajan con Degradación de Hidrocarburos Alifáticos, Monoaromáticos y Poliaromáticos.

Segundo examen parcial: Viernes 27 de mayo

A las 10 horas.

Temario:

Unidad 3: Biodegradación de compuestos selectos:

Hidrocarburos alifáticos (cadena lineal y cíclicos),
Hidrocarburos monoaromáticos,
Hidrocarburos aromáticos polinucleares.

El tema de Hidrocarburos alifáticos clorados, si bien se revisó en una de las clases, no está considerado para el examen.

Tarea Unidad 2

Realizar una investigación sobre la dispersión de contaminantes en desastres de gran impacto ambiental. Trabajo para ser elaborado por dos personas por sitio contaminado. Entregar en forma impresa, además de exposición oral, antes del segundo examen parcial. El trabajo debe estar relacionado a la asignatura de Biorremediación en lo general, y a la dispersión de contaminantes en lo particular. Se admiten como fuentes primarias de información  la Wikipedia, los artículos de periódicos, y sitios URL de internet. De manera preferente y de ser posible se consultarán fuentes secundarias en Redalyc y Dialnet, u otras bases de datos o sistemas de información.


En este enlace encontrarán ustedes un mapa interactivo de desastres ambientales a nivel mundial.

Este otro enlace es acerca de los Superfund Sites, los cuales son sitios o localidades contaminadas en los EUA que requieren una respuesta a largo plazo de limpieza de materiales tóxicos.

Y esto acerca del Top 10 de los desastres según un internauta (no les recomiendo que utilicen un traductor en línea, pues los resultados son pésimos).

Los temas elegidos hasta el momento (y que pueden cambiar ustedes en caso de no encontrar información pertinente) son:

Chernobyl, Ucrania (1986): Mariana & Diego;
Fukushima, Japón (2011): Brenda & Lucio;
Hiroshima, Japón (1945): Ana Karen & Paola;
BP, Golfo de México (2010): Israel & ?;
Ixtoc, Sonda de Campeche, Golfo de México (1979): Karina & Sara;
Exxon Valdez, Alaska (1989): Karina & Ma. Teresa;
Seveso, Italia (1976): Angélica & ?


A manera de ejemplos, una búsqueda en Redalyc arrojó esto:

Resultados para oil AND spill AND ixtoc	Resultados 1 - 4 de un total de 4 ( 0.0020 segundos )
[pdf] Redalyc. Impacto ecológico de la industria petrolera en la sonda de Campeche, México, tras tres décadas de actividad: una revisión . Interciencia(Relevancia: 3%) Interciencia Asociación Interciencia interciencia@ivic.ve ISSN (Versión impresa): 0378-1844 VENEZUELA 2004 J. Angel García Cuéllar / Francisco Arreguín Sánchez / Sergio Hernández Vázquez /...  Texto Completo 158,04 kB Resumen
[pdf] Redalyc. AMBIENTES INFLUIDOS POR EMANACIONES NATURALES DE HIDROCARBUROS Y GAS EN EL SUROESTE DEL GOLFO DE MÉXICO. Universidad y Ciencia (Relevancia: 2%) Universidad y Ciencia Universidad Juárez Autónoma de Tabasco ciencia.dip@ujat.mx ISSN: 0186-2979 MÉXICO 2004 L.A. Soto / S. Sánchez García / D. López Veneroni AMBIENTES INFLUIDOS POR...  Texto Completo 229,46 kB Resumen
[pdf] Redalyc. Diversity and ecological significance of deep-burrowing macrocrustaceans in coastal tropical waters of the americas (decapoda: thalassinidea) . Interciencia (Relevancia: 2%) Interciencia Asociación Interciencia interciencia@ivic.ve ISSN (Versión impresa): 0378-1844 VENEZUELA 2001 Darryl L. Felder DIVERSITY AND ECOLOGICAL SIGNIFICANCE OF DEEP-BURROWING...  Texto Completo 410,67 kB
[pdf] Redalyc. Perspectiva de la pesquería de camarón rosado (Farfantepenaeus duorarum burkenroad) en la sonda de Campeche, México . Ciencias Marinas (Relevancia: 2%) Ciencias Marinas Universidad Autónoma de Baja California cmarinas@uabc.mx, acabello@uabc.mx ISSN (Versión impresa): 0185-3880 MÉXICO 2000 Mauricio Ramírez Rodríguez / Ernesto A. Chávez /...  Texto Completo 110,06 kB Resumen

Otra búsqueda en internet, esto: http://www.epa.gov/BPSpill/

Esto otro acerca de Fukushima.

Que quede claro que son ejemplos. No deben basar su trabajo en una o dos referencias únicas.